La mayor amenaza para los agricultores mexicanos son las plagas. Las cinco más comunes son:
• Pulgón. Ataca principalmente al tomate, chile y papa. El daño principal que ocasiona es detener el desarrollo del fruto.
• Mosquita blanca. Esta plaga afecta a la calabacita, el brócoli, el tomate y el chile. Este insecto se alimenta de la savia de las hojas, provocando la pérdida temprana de la planta.
• Picudo. Es la que más daña a los cultivos de chile. Esta plaga es muy peligrosa porque se alimenta desde su etapa de larva hasta la adulta.
• Araña roja. Es un grupo de ácaros. Genera daños tanto en las hojas como en los frutos, ocasionando que se pudran y matando a la planta.
• Gallina ciega. Es una especie de escarabajo que afecta principalmente al maíz y sorgo. Deposita sus huevos en el suelo y sus larvas se alimentan de las raíces, matando al cultivo.